Το Σύνδρομο των Πολυκυστικών Ωοθηκών μπορεί σε βάθος χρόνου να προκαλέσει προβλήματα στην υγεία της γυναίκας.

Η παχυσαρκία έχει σημαντικό ρόλο στην εξέλιξη αλλά και στη σοβαρότητα των συμπτωμάτων του Συνδρόμου των Πολυκυστικών Ωοθηκών. Οι παράγοντες που οδηγούν στην παχυσαρκία των γυναικών με ΣΠΩ, εκτός από τη διατροφή, δεν είναι ακόμα σαφείς. Ενοχοποιείται τόσο η πρόσληψη όσο και η κατανάλωση ενέργειας και θερμίδων.

Το σύνδρομο των πολυκυστικών ωοθηκών είναι μία κατάσταση που οδηγεί σε μειωμένη αναπαραγωγική ικανότητα (κοινώς καλούμενη ως στειρότητα). Αυτό είναι αποτέλεσμα κυρίως της απουσίας περιόδου, πράγμα που σημαίνει ότι δεν υπάρχει απελευθέρωση ωαρίου, άρα δεν υπάρχουν και γόνιμες μέρες.

Το Σύνδρομο των Πολυκυστικών Ωοθηκών προκαλεί ποικιλία παθολογικών καταστάσεων. Είναι σημαντικό να επισημανθούν και οι ψυχολογικές επιπτώσεις που μπορεί να έχουν οι ασθενείς με πολυκυστικές ωοθήκες, οι οποίες συχνά παραβλέπονται, χωρίς όμως αυτό να σημαίνει πως δεν είναι σοβαρές και άξιες προσοχής.